高風險
    RFID所需的高額費用和技術上的不成熟，使實施RFID仍是高風險的舉動。甚至有人認為，如今所謂的RFID應用熱潮是一項缺乏投入回報證明的瘋狂技術冒進。
    雖然業(yè)界對RFID長期的前景仍堅持肯定的態(tài)度，但是，Gartner表示，應用這個技術的商業(yè)性的基本戰(zhàn)略還需要許多年才能成熟。企業(yè)開始在經(jīng)營管理和供應鏈中有效地使用條形碼技術用了20年的時間。RFID技術的普及雖然不會用那樣長的時間，但是，企業(yè)需要不斷地對采用這項技術的戰(zhàn)略進行檢查，并且要認識到RFID不可能在一個晚上成為主流的技術。

    價格過高
    價格問題也是關于RFID爭論的一大焦點。專家認為，要想實施這項技術，就必須把標簽的價格從現(xiàn)在的每個45美分降低到每個10美分。價格必須便宜到讓更多的公司使用的起，而現(xiàn)在產(chǎn)業(yè)正在朝著這個趨勢發(fā)展。而很多人現(xiàn)在仍在關注這個價格最終將降到多低，什么時候將達到這個最低點。

    標準不統(tǒng)一
    目前，很多RFID解決方案廠商提供的軟硬件技術還處于實驗室和模擬應用階段，尚不能適用現(xiàn)實應用的需要。如果企業(yè)采用專用技術，所使用的頻率、編碼、存儲規(guī)則以及數(shù)據(jù)內容等都不盡相同，一旦RFID解讀器和標簽不能通用，企業(yè)間就無法順利進行數(shù)據(jù)交換和協(xié)同工作，只得將RFID技術局限在企業(yè)內部。
    正是由于缺乏一套廣泛通用的標準，才使得RFID技術一直未能廣泛地應用于供應鏈管理上。當供應鏈其中一環(huán)的數(shù)據(jù)不能在下一環(huán)節(jié)再用時，就會使技術開發(fā)成本大幅增加?？梢姡粋€詳細、統(tǒng)一規(guī)范且開放的技術標準是RFID技術發(fā)展需要解決的頭等大事。

    失業(yè)
    市場調研公司YankeeGroup最近公布的研究報告顯示，未來三年企業(yè)將投資數(shù)十億美元安裝庫存追蹤(inventory-tracking)系統(tǒng)，這將使它們因供應鏈效率提高而節(jié)省成本，但數(shù)百萬工人卻將因此丟掉飯碗。
    YankeeGroup表示，制造商在未來三年將在與射頻標識(RFID)相關的硬件、軟件和服務方面投入50億美元。但是，布署RFID，僅在美國一地就可能導致400萬個工作崗位消失。

    健康影響
    目前有很多人對RFID遍布未來世界充滿擔心，因為RFID磁條所使用的800~900MHz已經(jīng)屬于甚高頻范圍，很多人擔心長期生活在RFID磁條包圍中會受到高頻射線影響，免疫力下降和導致癌癥都引發(fā)了很多人對RFID的疑問。而且RFID所使用的頻率也受到國際電信聯(lián)合會頻率資源的限制。

    隱私問題
    隱私保護團體也對RFID可能造成生產(chǎn)商長期跟蹤用戶抱有強烈的意見。而一旦使用一次性自毀RFID，顧客又很有可能在召回和折扣返款等服務上無法參與。