【編者按】在真實(shí)的場(chǎng)景下，NLP后的數(shù)據(jù)業(yè)務(wù)應(yīng)用，由于準(zhǔn)確率的問(wèn)題還是需采取“人工智能+人工審核”的方式來(lái)做到雙重保險(xiǎn)。

本文發(fā)于e醫(yī)療，作者：孫立峰；經(jīng)億歐大健康編輯，供行業(yè)人士參考。

自然語(yǔ)言處理（Natural Language Processing，NLP），是指人與計(jì)算機(jī)之間，通過(guò)“說(shuō)人話式”語(yǔ)言進(jìn)行有效通信的各種技術(shù)和方法。由于語(yǔ)言的復(fù)雜性，處理的過(guò)程會(huì)涉及“理解”，因此NLP被認(rèn)為距離人工智能最近的任務(wù)，也被稱(chēng)為“人工智能的皇冠”。

畢竟我們“人說(shuō)人話”有時(shí)候都很難，更別說(shuō)計(jì)算機(jī)了。

從臨床科研平臺(tái)信息化建設(shè)的發(fā)展歷程看，要想解決數(shù)據(jù)的完整性，就要通過(guò)ETL對(duì)多源多模態(tài)的數(shù)據(jù)進(jìn)行整合，也即整合不同廠商的DB，而且有些因?yàn)楦鼡Q系統(tǒng)原廠商已經(jīng)不再為醫(yī)院提供服務(wù)。一家醫(yī)院可能主流的數(shù)據(jù)庫(kù)ORACLE、SQLSERVER、MYSQL、DB2都有在用，市面上還有后關(guān)系型數(shù)據(jù)庫(kù)Caché。更換系統(tǒng)后，解決數(shù)據(jù)完整性的問(wèn)題，需要對(duì)歷史數(shù)據(jù)、生產(chǎn)數(shù)據(jù)全面整合。這也是為什么醫(yī)療公司的程序員們?cè)絹?lái)越吃香，被數(shù)據(jù)治理AI公司招攬得越來(lái)越多，到甲方工作的也越來(lái)越多——需求擺在那里，甲方給的待遇也越來(lái)越高了。

數(shù)據(jù)完整性的解決，也是為數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)生成高質(zhì)量后結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)的過(guò)程，NLP就是在這個(gè)過(guò)程中發(fā)揮作用，通過(guò)拆解語(yǔ)義元素分詞（區(qū)分魚(yú)和蝦），命名實(shí)體識(shí)別（確定這條是魚(yú)，那支是蝦），句法分析，語(yǔ)法分析，解決數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)化問(wèn)題；然后通過(guò)術(shù)語(yǔ)網(wǎng)絡(luò)，將數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化、歸一化，解決數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化（魚(yú)是魚(yú)、蝦是蝦）問(wèn)題。通過(guò)醫(yī)學(xué)知識(shí)圖譜的關(guān)聯(lián)和推理，解決基于醫(yī)學(xué)知識(shí)的推斷問(wèn)題，構(gòu)建患者畫(huà)像，在科研應(yīng)用、輔助診療、真實(shí)世界研究等方面才能深度應(yīng)用。

數(shù)據(jù)的結(jié)構(gòu)化是怎樣煉成的

（1）分詞

對(duì)于機(jī)器學(xué)習(xí)來(lái)說(shuō)分詞本質(zhì)上是一個(gè)分類(lèi)問(wèn)題，例如：武漢市長(zhǎng)江大橋，機(jī)器可以理解為：武漢_市長(zhǎng)_江_大橋，武漢市_長(zhǎng)江_大橋等等，機(jī)器會(huì)判斷一個(gè)字在一句句子中是作為詞的起始字（B），詞的中間字（I），詞的結(jié)尾字（E），還是一個(gè)單字詞（S），這樣就需要對(duì)文本進(jìn)行標(biāo)注，通過(guò)機(jī)器學(xué)習(xí)算法預(yù)測(cè)某些上下文的時(shí)候，判斷某個(gè)字作為BIES四個(gè)類(lèi)別中哪一個(gè)概率最高，最后通過(guò)BIES的識(shí)別完成分詞。

（2）詞性與關(guān)聯(lián)識(shí)別

一句檢查報(bào)告的放射學(xué)表現(xiàn)：右側(cè)脛骨髁間突骨端邊緣見(jiàn)骨質(zhì)增生變尖，關(guān)節(jié)在位、關(guān)節(jié)間隙未見(jiàn)狹窄，未見(jiàn)骨質(zhì)破壞及異常軟組織影。

我們要知道“右側(cè)”是方位，“脛骨髁間突”是身體結(jié)構(gòu)，“骨端”、“邊緣”是局部位置，“增生”、“變尖”是描述；我們要知道“右側(cè)+脛骨髁間突”是身體結(jié)構(gòu)方位的限定，“骨質(zhì)+增生”是身體結(jié)構(gòu)的變化。

命名實(shí)體識(shí)別（NER）就是從文中識(shí)別出命名性指稱(chēng)項(xiàng)，屬于什么實(shí)體類(lèi)別：疾病、檢查、治療、指標(biāo)、癥狀、身體部位……

命名實(shí)體關(guān)聯(lián)提?。∟ERE）就是對(duì)上一步得到的命名實(shí)體進(jìn)行處理，把存在關(guān)系的部分用關(guān)系類(lèi)別（包括：限定關(guān)系、修訂關(guān)系、因果關(guān)系……）將他們聯(lián)系起來(lái)，然后進(jìn)行語(yǔ)義依存分析。

術(shù)語(yǔ)標(biāo)準(zhǔn)化與知識(shí)圖譜

標(biāo)準(zhǔn)的應(yīng)用是很難的一件事情，比如ICD-10。最早是病案科（室）專(zhuān)業(yè)的編碼員去編碼，隨著電子病歷的推廣，有些醫(yī)院前移到臨床醫(yī)生填寫(xiě)、編碼員審核，有些公司CIS系統(tǒng)還開(kāi)發(fā)了俗名診斷與ICD編碼的映射關(guān)聯(lián)。

如醫(yī)生可能寫(xiě)：二型糖尿病、II型糖尿病、2型糖尿病、非胰島素依賴(lài)糖尿病，系統(tǒng)都自動(dòng)關(guān)聯(lián)到E11.952這個(gè)ICD編碼，但這各對(duì)照工作費(fèi)事費(fèi)力也會(huì)存在遺漏與偏差。這就需要術(shù)語(yǔ)標(biāo)準(zhǔn)化將數(shù)據(jù)歸一化。

同時(shí)我們還想知道糖尿病是內(nèi)分泌疾病，糖尿病是代謝性疾病，糖尿病是胰島功能紊亂，這就需要構(gòu)建強(qiáng)大的術(shù)語(yǔ)網(wǎng)絡(luò)建立知識(shí)圖譜。

術(shù)語(yǔ)集如疾病庫(kù)和臨床發(fā)現(xiàn)庫(kù)基于SNOMED-CT、MedDRA、ICD-10、ICD-9-CM-3、RadLex、CMeSH，如藥品和檢驗(yàn)庫(kù)，基于CFDA藥物信息和LOINC，同時(shí)還需要儲(chǔ)備大量的術(shù)語(yǔ)資源庫(kù)，將各術(shù)語(yǔ)庫(kù)內(nèi)部關(guān)聯(lián)，根據(jù)分類(lèi)、邏輯以及臨床習(xí)慣分類(lèi)，如影像與疾病庫(kù)的關(guān)聯(lián)、檢驗(yàn)庫(kù)與疾病庫(kù)的關(guān)聯(lián)等等。

利用自然語(yǔ)言處理、術(shù)語(yǔ)標(biāo)準(zhǔn)化、醫(yī)學(xué)知識(shí)圖譜三大核心技術(shù)，解決醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)完整性、醫(yī)療數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化、醫(yī)學(xué)與算法融合的三大醫(yī)療數(shù)據(jù)利用的核心問(wèn)題。這樣，高質(zhì)量的數(shù)據(jù)就可以深度應(yīng)用。

如智能檢索?；谧匀徽Z(yǔ)言處理引擎結(jié)構(gòu)化和標(biāo)準(zhǔn)化以后的后臺(tái)數(shù)據(jù)進(jìn)行搜索，因此能處理同一概念不同表述形式、否認(rèn)、指代等關(guān)系，以及對(duì)某一報(bào)告中數(shù)值型變量進(jìn)行搜索，這些功能通過(guò)常規(guī)搜索方案是完全無(wú)法實(shí)現(xiàn)的。

例如“先天性心臟病”的搜索，同上面“非胰島素依賴(lài)糖尿病”的例子一樣，除了能檢索到使用“先心病”、“先天心臟畸形”、“先天性心臟異?！钡炔灰?guī)范書(shū)寫(xiě)診斷進(jìn)行表述的患者，也能搜索所有屬于“先天性心臟病”的子概念，例如“室間隔缺損”、“完全性大動(dòng)脈轉(zhuǎn)位”、“雙心室”等，極大的強(qiáng)化了查全率。

再以上面講的ICD編碼為例，理想的ICD自動(dòng)化編碼，至少需要從病案首頁(yè)、出院小結(jié)、病理報(bào)告和手術(shù)記錄四種文本源中尋找編碼依據(jù)，并按照符合ICD_10的標(biāo)準(zhǔn)編碼規(guī)范邏輯進(jìn)行診斷信息編碼。因此，一個(gè)NLP自動(dòng)化編碼不但需要對(duì)文本信息抽取，還需要對(duì)知識(shí)和邏輯進(jìn)行管理，最終整合產(chǎn)生輸出。

有多少人工，就有多少智能

上面說(shuō)了百度NLP在鑒黃語(yǔ)言的應(yīng)用，百度和騰訊都有AI開(kāi)放平臺(tái)，開(kāi)放的技術(shù)引擎有：OCR（在醫(yī)療應(yīng)用的如身份證OCR、手寫(xiě)病歷OCR等）、人臉識(shí)別（身份驗(yàn)證、醫(yī)保刷臉支付等）、圖片識(shí)別、自然語(yǔ)言處理等。

為什么BAT免費(fèi)開(kāi)放NLP技術(shù)引擎，還會(huì)涌出這么多專(zhuān)注于NLP的醫(yī)療公司呢？這就是一般NLP和醫(yī)學(xué)NLP的區(qū)別。醫(yī)學(xué)語(yǔ)言的溝通本身除了涉及大量的醫(yī)學(xué)術(shù)語(yǔ)、縮略語(yǔ)、簡(jiǎn)稱(chēng)，還涉及醫(yī)學(xué)知識(shí)和邏輯，因此很多時(shí)候醫(yī)生書(shū)寫(xiě)的內(nèi)容，不是專(zhuān)業(yè)人士可能幾乎看不懂，更不用說(shuō)計(jì)算機(jī)了。

為了實(shí)現(xiàn)利用NLP進(jìn)行信息抽取，需要在常規(guī)NLP流程的每一個(gè)步驟進(jìn)行針對(duì)醫(yī)學(xué)的調(diào)整。需要處理醫(yī)學(xué)的詞、醫(yī)學(xué)的句子、醫(yī)學(xué)的詞與詞之間的關(guān)系，讓計(jì)算機(jī)沿著醫(yī)學(xué)邏輯推理信息；需要針對(duì)全科室病歷、專(zhuān)科病歷、專(zhuān)病病歷、檢查報(bào)告、病理報(bào)告等不同類(lèi)型文本均衡抽樣，在金標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)集的基礎(chǔ)上進(jìn)行醫(yī)學(xué)語(yǔ)料訓(xùn)練，各種算法針對(duì)不同業(yè)務(wù)場(chǎng)景進(jìn)行分詞。

決定NLP算法性能的是醫(yī)學(xué)文本標(biāo)注的“質(zhì)”與“量”。“量”由不同的樣本解決，同時(shí)因?yàn)槊總€(gè)人對(duì)文本的理解不同，其存在最大的問(wèn)題就是同一份文本標(biāo)注的不一致，所以需要一套標(biāo)準(zhǔn)的分層標(biāo)注流程——分段→分詞→實(shí)體分類(lèi)標(biāo)注→簡(jiǎn)單關(guān)聯(lián)標(biāo)注→復(fù)雜關(guān)聯(lián)標(biāo)注→檢查修改→最終標(biāo)注審核——來(lái)解決“質(zhì)”的問(wèn)題。

當(dāng)然，“量”也需要有“質(zhì)”的“量”。

病歷不同于一般的自由文本，其中的挑戰(zhàn)就是文中沒(méi)有實(shí)際指出但隱含的概念，另外中國(guó)語(yǔ)言博大精深，臨床敘事中呈現(xiàn)的信息是無(wú)結(jié)構(gòu)的、無(wú)語(yǔ)法的。所以文本標(biāo)注體系復(fù)雜，非常依賴(lài)醫(yī)學(xué)專(zhuān)業(yè)支持，標(biāo)注成本極高。一份病歷的標(biāo)注就需要兼職（醫(yī)學(xué)院即將畢業(yè)的大學(xué)生）、專(zhuān)職（醫(yī)生）多人去完成。

廣為流傳的故事，當(dāng)年舊金山挖金子的沒(méi)賺到錢(qián)，賣(mài)水的賺了大錢(qián)。而一個(gè)叫布瑞南的商人，因?yàn)橐u(mài)鍬，去吆喝金子，最后他的鍬賣(mài)出去了，金礦也被開(kāi)采出來(lái)了。所以在如雨后春筍般成立的人工智能公司（“挖金礦”）的背后，催生了一批靠做標(biāo)注生存的小公司（“賣(mài)水”），當(dāng)然也有公司兼做標(biāo)注和醫(yī)院聯(lián)合做科研。只是現(xiàn)在的醫(yī)療AI市場(chǎng)，還處于“叫好不叫座”階段，有時(shí)還要“羊毛出在狗身上，豬來(lái)買(mǎi)單”。

在和醫(yī)院交流的時(shí)候，被問(wèn)到最多的一個(gè)問(wèn)題還是自然語(yǔ)言處理準(zhǔn)確率的問(wèn)題：99%的準(zhǔn)確率，那1%是否還需要人為100%再去校驗(yàn)一次？

由于技術(shù)限制，自由文本機(jī)器提取的數(shù)據(jù)肯定存在誤差。是要“準(zhǔn)”還是要“全”，要根據(jù)實(shí)踐來(lái)平衡——如是臨床研究數(shù)據(jù)采集，答案肯定是“是”，因?yàn)榕R床數(shù)據(jù)的錄入原則上是要接受雙重或多重核查機(jī)制的，要的是“準(zhǔn)”；如果是智能檢索，系統(tǒng)需要的是縮小人工檢索符合標(biāo)準(zhǔn)的范圍和數(shù)量，需要的是“全”。用機(jī)器一次性解決問(wèn)題的方案目前還不存在。

也就是說(shuō)，在真實(shí)的場(chǎng)景下，NLP后的數(shù)據(jù)業(yè)務(wù)應(yīng)用，由于準(zhǔn)確率的問(wèn)題還是需采取“人工智能+人工審核”的方式來(lái)做到雙重保險(xiǎn)。